Vía aérea: el aeropuerto más cercano es el de Posadas distante a 60 kilómetros. Hay vuelos diarios desde y hacia Buenos Aires.
Otros aeropuertos: Iguazú, a 300 kilómetros, Asunción (Paraguay) a 390 kilómetros.
Vía terrestre: San Ignacio está ubicada a la vera de la Ruta Nacional Nº 12, a 60 kilómetros de Posadas. Líneas de transporte regular desde la terminal de ómnibus de Posadas y Puerto Iguazú. Excursiones desde las principales ciudades de la Provincia.