San Rafael es el segundo departamento en importancia y extensión territorial de la Provincia de Mendoza.
Posición geográfica: 68°19´50” longitud Oeste; 34° 36´58” latitud Sur.
Limita al Norte: San Carlos, Santa Rosa y La Paz
Al Sur: Malargue y La Pampa
Al Este: General Alvear y San Luis
Al Oeste: República de Chile
San Rafael esta conformado por cuatro unidades geomorfológicas:
CORDILLERA DE LOS ANDES: formación terciaria sobre sedimentos mesozoicos.
DEPRESION DE LOS HUARPES: 300 km de lado por 50 km de ancho, aspecto llano, rellenado por sedimentos cuaternarios de distintos orígenes.
BLOQUE EXHUMADO SAN RAFAEL: comprende el área central con orientación noroeste a Sur Este, muy erosionada.
LLANURA DE LA TRAVESIA: es una llanura que ocupa la porción Este del Departamento.